Η εξαφάνιση πολλών πλοίων έχει θέσει σε κίνδυνο τη ναυσιπλοΐα στα διεθνή ύδατα. Με την υποψία ότι πρόκειται για απειλή από κάποιο μυστηριώδες θαλάσσιο τέρας, οργανώνεται μια αποστολή για την καταδίωξή του, με μέλη τον καθηγητή Πιερ Αρονάξ, τον πιστό του υπηρέτη Κονσέιγ και τον Καναδό φαλαινοθήρα Νεντ Λαντ. Το τρομερό πλάσμα τούς ρίχνει στη θάλασσα, αλλά διασώζονται από τον Ναυτίλο, ένα υποβρύχιο προηγμένης τεχνολογίας με κυβερνήτη τον ανεξιχνίαστο πλοίαρχο Νέμο. Μαζί του θα ανακαλύψουν τα θαύματα του θαλάσσιου βυθού.